其实，至于黄恩为什么会受到风波的牵连而被驳回课题，多少有些利益链条拴在里面，它死死地锁住领导层和基层，你只要不干净，就会被链条锁住，与他人命运与共。这里面还有很多奥秘，这里不便多说。
同事们大都知道黄恩是被冤枉的无辜的替罪羊，但职场艰险，他们也都选择了明哲保身，把这件事情埋在心底，不愿再提。
那么黄恩怎么样呢？他倒还好，毕竟工作没丢，理想还在，他选择乐观面对，他也没有继续申诉，不想更深地卷入这场无硝烟、看不见的战争中去。他认为，过去的事就让他过去吧，没什么大不了的，未来的路还要靠自己走。正如一句俗话所说的那样：天要下雨，娘要嫁人，由他去吧！他就是这样的乐观豁达的处事态度。
虽然黄恩科研之路收到了不小的波动和阻碍，但他依旧在默默忙于他博士时期的课题。每天穿梭于实验室、图书馆之间，常常废寝忘食。
黄恩的理论研究有了新进展，他目前主要面对两个待攻克的技术难题，它们分别是：
（一），制造“人造病毒”，必须进行大规模的大分子空间构象的调整和集体组装，这些是非常困难的，对技术的要求极高。要想通过分子重组，3D打印技术实现超大高精度分子群的网络构建，已经基本实现，只是时间问题罢了。但是，对那些3D打印的分子群和某些生物大分子而言，如何对它们进行空间构想的转变和镶嵌是个难题，说的简单一点，就好比蛋白质的一级结构是多肽链，它按照特定的氨基酸序列进行排列，目前人类已经能够非常轻易的实现大规模批量生产自然界有的，甚至人造的以任意氨基酸序列排列构成的多肽链，在此基础上演化出了第一代基因工程和第二代基因工程，即一般意义上的蛋白质工程。而多肽链的盘曲折叠形成了蛋白质的二级结构。然而，在二级结构的基础上，多条进行了不规则盘曲折叠、不同长度的多肽链相互盘绕、扭曲、组合，以及在和更多这种类似的组合体通过更加复杂、庞大的变形，组装成一个更大的复杂有机体——具有生物活性的蛋白质，这就衍生出了蛋白质的第三和第四级结构，而第三和第四级结构是非常困难的。黄恩面临的第一个重要难题就在这里，如何实现人造生物大分子的有机组装，是进行“人造病毒”实验的第一步。他就好像你要走完万里长城所迈出的第一步一样，意义非凡而且责任重大！
（二）大分子结构的组装的硬性技术难题如果攻破了，还远远不够。如何有意识地正确地设计出理想的生物大分子也是关键。如果给你五个不同的氨基酸，根据排列组合的数学原理，它共有5的全排列——5！＝5×4×3×2×1=120种组合方式，更别说出现在生物体上的α-氨基酸共有21种了，若再结合β-氨基酸等的组合那就是天文数字，它的数值可能大于银河系内的所有行星！！所以要想有意识地人工制造具有生物活性和理想功能的生物大分子，堪比登天还难！！
而且并不是所有组合都有生物活性和预期功能的，甚至与目标蛋白质差一个氨基酸分子的蛋白质的作用也是天差地别！就拿血红蛋白变异引起的镰刀型红细胞贫血来举个例子吧：正常成人血红蛋白是由两条α链和两条β链相互结合成的四聚体，α链和β链分别由141和146个氨基酸顺序连结构成。镰状细胞贫血患者因β链第6位氨基酸谷氨酸被缬氨酸所代替，形成了异常的血红蛋白S（hemoglobin S，HbS），取代了正常血红蛋白（HbA），在氧分压下降时HbS分子间相互作用，成为溶解度很低的螺旋形多聚体，使红细胞扭曲成镰状细胞（镰变）。红细胞内HbS浓度、脱氧程度、酸中毒、红细胞脱水程度等许多因素与红细胞镰变有关。
总的说来，设计大分子结构要精确到每一个组成分子本身；组装大分子要精细化地调整大分子的空间构象。这些技术难题对于21世纪下半叶的人类社会来说也是重大技术难题，尚且有待科学界出现第二个爱因斯坦、普朗克等人力挽狂澜，实现从理论到技术的伟大突破。但想爱因斯坦、普朗克、薛定谔这样的旷世奇才千百年来又能降生几人呢？
现在人类的科学技术似乎到达了瓶颈，科学不再是最初的那样纯真，以探寻真理为目的的想象和实验，而是逐渐演化成了一种极为变态的形态，以商业价值作为第一目的。科学家和企业家一样，不再想着科学进步能给人类什么样的答案，而是能否给他们带来经济价值，说得露骨点：这个课题能否给他们带来钱！
不少科研单位包括高校也都在向着公利化方向发展，不少高校都要求老师的每年论文产量，包括高校招收老师 第一要素也是你的论文产量和论文原产地（即在哪个学术期刊发表的），而很少谈及内容和目的。
这种科研的逐渐功利化必将使得人类的科学技术遇到瓶颈，难以发生本质性的突破。科学技术的突破源于理论物理学、理论化学、数学的突破，而这些学科逐渐被人们定位为“天坑专业”“不挣钱的行当”，这些势必导致每年报考这些领域的考生越来越少，人才流入不足，学术进展迟缓，突破遭遇瓶颈等。
理论科学难以突破，加之资本逐渐侵占学术界，使得学术界这一片“净土”也开始出现乌烟瘴气，使得学术界近年来不断爆出惊世骇俗的绯闻等等。人类的科学研究究竟为了什么，该何去何从，需要有个明确的答案。